MDGRAPE-3ボード

6月19日 発表

　独立行政法人理化学研究所(理研)は19日、インテル株式会社および日本SGI株式会社と協力し、理論ピーク性能1PFLOPS(Peta FLOPS)を実現する分子動力学シミュレーション専用システム「MDGRAPE-3」を構築したと発表した。

MDGRAPE-3システム

　MDGRAPE-3は、理研が開発した同名の分子動力学シミュレーション専用LSIを4,808個搭載したシステムに、デュアルコアXeonを256個搭載したサーバーを64台、Xeon 3.2GHzを74個搭載したサーバーを37台接続したもの。

　同システムでは、スーパーコンピュータ性能ランキング「TOP500」で用いられるベンチマークLinpackを実行できないため直接比較できないが、理論ピーク性能は1PFLOPSに達し、TOP500で現在1位のIBM BlueGene/L(360TFLOPS)の約3倍に相当する性能だとしている。

　MDGRAPE-3は、タンパク質の働きをシミュレーションし、病気を引き起こす仕組みの解明などに利用される。

　なお、同システムは、6月24日に開催される理研横浜研究所の一般公開で披露される。

□理研のホームページ
http://www.riken.jp/
□ニュースリリース
http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2006/060619/index.html
□インテルのホームページ
http://www.intel.co.jp/
□ニュースリリース
http://www.intel.co.jp/jp/intel/pr/press2006/060619.htm
□日本SGIのホームページ
http://www.sgi.co.jp/
□ニュースリリース
http://www.sgi.co.jp/newsroom/press_releases/2006/jun/mdgrape.html

(2006年6月19日)

[Reported by wakasugi@impress.co.jp]